タンパク質立体構造の予測へむけて:物理化学的モデルとデータベースによる最適化
神大自然・科技団TOREST
藤墳佳見,○高田彰二
Abstract
アミノ酸配列からタンパク質分子の立体構造を決定することは、その機能解明のために必須の課題である.本研究では、理論計算による構造予測のために、独自の粗視化分子モデルを構築し、現存する構造データベースを利用してその精度を最適化を行った.さらに、構築したモデルによるタンパク質フォールディングのベンチマークテストを行う.
Protein structure determination is a key issue for understanding its function. For theoretical protein structure prediction, we construct a coarse-grained molecular model of proteins, and optimize the model using available protein structure database. We also test the model by performing protein folding simulation.